Пациента, которому поставлен диагноз и проведено обследование, направляют в онкологическое отделение и проводят химиотерапию. (При остеосаркоме и саркоме Юинга химиотерапия является стандартным методом лечения, тогда как при хондросаркоме химиотерапия эффективна только для некоторых ее типов.) Пациенту, прошедшему полный курс химиотерапии, делают контрольный рентген и МРТ, и проводят операцию. Во время операции, кость, имеющая злокачественное поражение, удаляется и на ее место устанавливается протез, также полость может быть заполнена собственной костью (малоберцовая кость) или же удаленную пораженную кость очищают и после некоторых процедур (обработка жидким азотом или лучевая терапия) ставят на место с помощью имплантата / пластины. Пациент с зажившей послеоперационной раной, снова направляется в онкологическое отделение для проведения курса химиотерапии.